綠島屬亞熱帶季風氣候，全年溫暖、潮濕、多風，海洋性氣候濃厚，年平均溫攝氏23.5度，四至八月受到西南氣流影響，七月至九月常有颱風侵襲，十月至翌年三月則是受到東北季風影響，全年強風天多達160餘天，綠島多雨，並無顯著乾濕季，年平均雨量達二四九八公厘；多變的氣候，左右了綠島人的生活，影響島上動植物生態，也造就了綠島豐富的風貌。
本區氣候溫暖，四季變化並不顯著，夏季氣溫較高，冬季溫度較低。一年之中，溫度以六月至九月為高，其中七、八月氣溫最高，平均為29°C左右；溫度最底則為一至二月，平均在20°C左右。
本區洋流受黑潮暖流影響，蘭嶼、綠島即位於黑潮北流的路線上，以綠島而言，黑潮宜撲龜灣，一部份掠過綠島東岸，因此帆船鼻一帶經常波濤洶湧，行船不易。由於屬於暖流的海域，即使冬天水溫也維持在20度以上，一年四季皆適宜潛水、浮潛活動。
一般人印象中會覺得綠島冬天會很冷，事實上台東跟綠島位於中央山脈的東南側，且緯度相同於高雄屏東，都在北回歸線以南，大陸冷氣團侵襲的時候，部分冷空氣被中央山脈給擋住，在台東最低的溫度也有13~14度，平常冬季氣溫都在20~27度之間，相較於台灣其他地區較為溫暖，而綠島又因為有黑潮暖流的影響，海水溫度終年在20度以上，陸地上的氣溫最低也不過15度左右。只不過綠島因為四周圍沒有任何屏障，每當夏季的西南氣流、颱風，冬季的東北季風影響下，常常會有比較強的風勢與較差的海象，常讓會暈船的人怯步不敢到綠島玩。綠島不同於其他台灣的離島例如金門、馬祖、澎湖，冬季時也很適合旅遊與參加潛水、浮潛的活動，另外還有熱呼呼的朝日溫泉可以泡湯！
在冬季的時候不冷不熱的天氣是最適合到台東跟綠島旅遊的季節，可以安排台東冬季賞花或騎鐵馬泡湯的行程，再搭配綠島的旅遊，感受不同於夏天熱鬧喧囂的綠島，一個屬於真正的綠島漁村寧靜的樂活生活，以下有個冬季的旅遊行程，提供給各位參考看看：
綠島冬季旅遊行程：
兩天一夜的旅遊行程：
第一天：
一早出發前往台東，之後至富岡漁港搭交通船(不過由於冬季遊客少，船班比較少出發前要先確定船班時間)，船程約50分鐘(冬季的風浪會比較大些怕搭船盡量選擇船中尾部分的座位，不要隨意走動，開船之後閉上眼睛休息，快暈船的時候深呼吸不要緊張或者喝口水可以緩和症狀，另外還有吃梅仔或聽mp3都會有幫助)，抵達綠島後牽機車加油回民宿放置行李。天氣好時綠島的溫度都在20度以上，下午可以安排浮潛活動，如遇到寒流或東北季風建議改搭玻璃船一樣可以欣賞海底美景；傍晚到大白沙或石朗浮潛區觀賞夕陽，綠島冬天的夕陽因為下山的位置偏南約莫大武墾丁的方向，此時的夕陽是最紅最漂亮的。
晚上逛逛鬧街吃個小吃，參加民宿的夜遊導覽行程，冬季因為遊客少，觀賞到的梅花鹿的數量比夏季多，還會聽到雄鹿進入發情期的鳴叫聲。還可以觀賞冬季的星空，此時可以觀賞到冬季大三角(獵戶.大犬.小犬)、金牛、雙子等星座，夜遊結束到朝日溫泉泡湯煮蛋，享受悠閒樂活的綠島生活。
第二天：
依前一晚夜遊所介紹的景點，早上安排環島詳細的遊歷一番，各個景點拍照及參觀人權文化園區(綠洲山莊&新生訓導處的影音中心與蠟像館)，中午回商店街用餐，可搭乘中午12:30 or 14:30的客輪返回台東，搭乘火車或開車回家。(回程因為順著黑潮，通常會比去程時後平穩許多，較不用怕暈船)
三天兩夜的旅遊行程：
第一天：
一早出發前往台東，之後至富岡漁港搭交通船(不過由於冬季遊客少，船班比較少出發前要先確定船班時間)，船程約50分鐘(冬季的風浪會比較大些怕搭船盡量選擇船中尾部分的座位，不要隨意走動，開船之後閉上眼睛休息，快暈船的時候深呼吸不要緊張或者喝口水可以緩和症狀，另外還有吃梅仔或聽mp3都會有幫助，抵達綠島後牽機車加油回民宿放置行李。下午先安排順時針環島行程熟悉一下綠島的環境，傍晚約4~5點到大白沙或石朗浮潛區觀賞夕陽，綠島冬天的夕陽因為下山的位置偏南約莫大武墾丁的方向，此時的夕陽是綠島一年四季中最紅最漂亮的。
晚上逛逛鬧街吃個小吃，參加民宿的夜遊導覽行程，冬季因為遊客少，觀賞到的梅花鹿的數量比夏季多，還會聽到雄鹿進入發情期的鳴叫聲。還可以觀賞冬季的星空，此時可以觀賞到冬季大三角(獵戶.大犬.小犬)、金牛、雙子等星座，夜遊結束返回民宿休息！
第二天：
天氣好時綠島的溫度都在20度以上，早上可以安排浮潛活動，如遇到寒流或東北季風建議改搭玻璃船一樣欣賞海底世界；由於綠島冬季溫度適宜不會太熱或太冷，很適合安排健行古道之旅，下午可以安排人權文化園區的巡禮，參觀新生訓導處&綠洲山莊，監獄體驗與第三大隊影音館與蠟像館，另外安排過山古道、過山步道或牛頭山等步道的行程，此時的綠島氣溫適合健行，行走在步道中，享受大自然的寧靜，晚上在街上用餐逛街，之後安排朝日溫泉泡湯煮蛋，返回民宿休息。
第三天：
用過早餐之後，安排逆時針的環島的旅遊行程，不同的方向角度看綠島，可以欣賞到不同的風景。中午用完餐之後，搭乘2:30的船返回台東。(回程因為順著黑潮，通常會比去程時後平穩許多，較不用怕暈船)
台東綠島冬季的旅遊行程：
三天兩夜的旅遊行程：
第一天：
先搭火車到台東之後，行李寄放在民宿內，下午安排台東市附近的景點走走，可以到初鹿牧場逛逛，下午返回台東經過卑南包子買個肉包吃^^，再到海濱公園騎鐵馬(寶桑亭、台東森林公園琵琶湖、活水湖、鐵道藝術村、鯉魚山、舊鐵道廊道)，傍晚到知本溫泉泡個湯，晚上返回台東逛觀光夜市吃小吃(米苔目.臭豆腐)，返回民宿休息。
第二天：
早上安排民宿附近的景點(國立卑南文化公園、卑南水圳公園)走走，至富岡漁港搭乘9:30的船前往綠島(不過由於冬季遊客少，船班比較少出發前要先確定船班時間)，船程約50分鐘(冬季的風浪會比較大些怕搭船盡量選擇船中尾部分的座位，不要隨意走動，開船之後閉上眼睛休息，快暈船的時候深呼吸不要緊張或者喝口水可以緩和症狀，另外還有吃梅仔或聽mp3都會有幫助)，抵達綠島後牽機車加油回民宿放置行李。天氣好時綠島的溫度都在20度以上，下午可以安排浮潛活動，如遇到寒流或東北季風建議改搭玻璃船一樣可以欣賞海底；傍晚到大白沙或石朗浮潛區觀賞夕陽，綠島冬天的夕陽因為下山的位置偏南約莫大武墾丁的方向，此時的夕陽是最紅最漂亮的。
晚上逛逛鬧街吃個小吃，參加民宿的夜遊導覽行程，冬季因為遊客少，觀賞到的梅花鹿的數量比夏季多，還會聽到雄鹿進入發情期的鳴叫聲。還可以觀賞冬季的星空，此時可以觀賞到冬季大三角(獵戶.大犬.小犬)、金牛、雙子等星座，夜遊結束到朝日溫泉泡湯煮蛋，享受悠閒樂活的綠島生活。
第三天：
依前一晚夜遊所介紹的景點，早上安排環島詳細的遊歷一番，各個景點拍照及參觀人權文化園區(綠洲山莊&新生訓導處的影音中心與蠟像館)，中午回商店街用餐，可搭乘中午12:30 or 14:30的客輪返回台東，搭乘火車或開車回家。(回程因為順著黑潮，通常會比去程時後平穩許多，較不用怕暈船)
台東『砂城小布民宿』＆綠島『翔鼎民宿』
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